文献类型: 中文期刊
作者: 刘冬梅 1 ; 洪权春 2 ; 陈文超 3 ; 丁锦平 2 ; 陈姝彤 2 ; 徐园园 2 ; 韩霜 2 ; 朱晓琴 2 ; 王亚月 2 ; 裴冬丽 2 ;
作者机构: 1.商丘师范学院生物与食品学院植物与微生物互作省级重点实验室河南省干制辣椒产业技术院士工作站
2.商丘师范学院生物与食品学院植物与微生物互作省级重点实验室
3.湖南省蔬菜研究所
关键词: 辣椒素;pAMT;基因家族;生物信息学分析
期刊名称: 辣椒杂志
ISSN: 1672-4542
年卷期: 2019 年 003 期
页码: 1-8
摘要: 为研究辣椒氨基转移酶(pAMT,putative aminotransferase)基因在辣椒基因组中的分布和功能,以尊辣1号基因组为参照,利用生物信息学方法对辣椒中pAMT基因家族成员进行全基因组水平分析.结果显示:辣椒基因组中存在9个pAMT基因家族成员,集中分布在8号和9号染色体上,氨基酸序列多重比对显示这9个蛋白分别聚类到3大分支上.结构分析表明,pAMT家族所有蛋白均含有5个保守结构域Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 8和Motif 9.基因表达分析结果显示:基因Capana09g000427在叶片中不表达,在果皮中表达量最高,其次是子房,在种子和胎座也有表达.基因Capana08g000160在种子、胎座中不表达,仅在叶片中表达稍高,在其他组织的表达量均较低.辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析为进一步研究辣椒氨基转移酶pAMT基因家族的功能提供了科学依据.
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