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水稻GATA基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 骆鹰 1 ; 王有成 1 ; 王伟平 1 ; 张超 1 ;

作者机构： 1.湖南科技学院化学与生物工程学院;湖南农业大学农学院;杂交水稻国家重点实验室湖南杂交水稻研究中心

关键词： 水稻;保守域;基因表达;生物信息学分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 17 期

页码： 5514-5522

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： GATA基因家族是生物中一类重要的转录因子,在动植物生长发育、细胞分化以及植物响应环境变化中发挥重要作用。为揭示水稻中GATA家族特征及表达模式,利用生物信息学的方法对水稻GATA家族进行序列比对分析、保守结构域分析、蛋白三级结构分析以及GATA家族表达谱分析。本研究揭示了水稻GATA家族含有共同的GATA结合域,其蛋白三级结构整体相似性较高,组织中的表达水平呈丰富多样性,在激素应激中开启了不同的表达响应模式。这为进一步研究GATA基因家族成员的生物学功能提供参考依据,同时为水稻中其他基因家族研究提供指导。

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