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苦瓜果实商品成熟期均一化全长cDNA文库的构建及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 胡新军 1 ; 李勇奇 1 ; 袁祖华 1 ; 粟建文 1 ;

作者机构: 1.湖南省蔬菜工程技术研究中心/湖南省蔬菜研究所

关键词: 苦瓜;果实;全长cDNA文库;均一化;EST分析

期刊名称: 中国农学通报

ISSN: 1000-6850

年卷期: 2017 年 33 卷 12 期

页码: 82-87

摘要: 为构建苦瓜果实商品成熟期的cDNA文库,并对相关EST进行序列分析,笔者以多肽二号苦瓜亲本‘189-4’商品成熟期果实为材料,利用SMART技术构建其果实的cDNA文库。经检验该文库库容量为2.08×10~6,重组率为96.29%,平均插入片段750~2000 bp,插入片段平均大小约1000 bp。随机挑取400个单克隆进行测序,共获得370条EST,序列分析结果表明350条有同源性,全长率为70%;19条序列无匹配,单一序列为320条,其中,片段重叠群10个,单基因260个,可能与营养品质相关的基因有48个。本研究为苦瓜果实功能基因的筛选、克隆奠定了基础。

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