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侵染湖南甘薯种质资源的曲叶病毒和杆状病毒的检测及其亲缘关系分析

文献类型： 中文期刊

作者： 黄艳岚 1 ; 张超凡 1 ; 张道微 1 ; 董芳 1 ; 邹学校 2 ;

作者机构： 1.湖南省农业科学院作物研究所

2.湖南农业大学

关键词： 甘薯种质资源;甘薯曲叶病毒;甘薯杆状病毒;鉴定与分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2021 年 009 期

页码： 2666-2673

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用PCR技术对2015—2016年从湖南省多个市县采集的180份甘薯种质资源进行两种DNA病毒（sweet potato leafcurlvirus,SPLCV和sweetpotatobadnavirus,SPBV）检测,并以PCR扩增产物序列为基础,对这两种病毒的亲缘关系进行分析。结果表明:（1）180份甘薯种质资源中,22份检测出SPLCV,占总数的12.2%;32份检测出SPBV,占总数的17.8%;8份同时检出SPLCV和SPBV这两种病毒,占总数的3.9%。（2）检出SPLCV的市县有长沙、永州、怀化、邵阳、郴州、常德、娄底、益阳、岳阳和株洲;检出SPBV的市县有长沙、永州、怀化、衡阳和邵阳;检出两病毒复合侵染的市县有怀化、长沙、永州和邵阳。（3）基于病毒全基因组序列分析显示,全球已报道的36个SPLCV分离物可分为3组,本研究获得的12个湖南分离物可分别归于3个组中,其中6个归于组Ⅰ,1个归于组Ⅱ,5个归于组Ⅲ,表明湖南SPLCV具有高度多样性。（4）基于病毒运动蛋白和外壳蛋白编码基因部分序列分析显示,全球已报道的36个SPBV分离物可分为4组,绝大部分分离物属于组Ⅰ,我国1个安徽分离物单独成组（组Ⅱ）,我国2个山东分离物和1个海南分离物构成1个组（组Ⅲ）,本研究获得的2个湖南分离物其中1个归于组Ⅰ,而另1个与已报道各分离物的核苷酸序列均存在显著差异,相似性仅为74.92%,单独成组（组Ⅳ）,表明我国SPBV具有高度的变异性,存在多个变异类型。本研究结果可为湖南地区这两种病毒病防控提供依据。

  • 相关文献

[1]湖南甘薯种质资源曲叶病毒检测分析初报. 张道微,黄艳岚,周虹,余应弘,张超凡. 2017

[2]甘薯杆状病毒湖南分离物基因组全序列测定及比较分析. 黄艳岚,张超凡,邹学校. 2019

[3]Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒. 张道微,董芳,张超凡,邹学校. 2019

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