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西瓜枯萎病菌遗传多样性的相关序列扩增多态性分析

文献类型： 中文期刊

作者： 肖姬玲 1 ; 张屹 1 ; 朱菲莹 1 ; 魏林 1 ; 梁志怀 2 ;

作者机构： 1.;湖南大学研究生院隆平分院;湖南省农业生物技术研究所;湖南省植物保护研究所

2.;湖南大学研究生院隆平分院;湖南省农业生物技术研究所;湖南省植物保护研究所;

关键词： 西瓜枯萎病菌;SRAP分析;遗传多样性

期刊名称： 植物保护

ISSN： 0529-1542

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 194-198

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对30个西瓜枯萎病菌Fusarium oxysporum f.sp.niveum菌株基因组DNA进行相关序列扩增多态性(SRAP)分子标记分析,以探究其遗传多样性与地理来源的关系。采用尖孢镰刀菌西瓜专化型Fusarium oxysporumf.sp.niveum0、1、2号生理小种的基因组DNA为模板,对225对SRAP引物进行筛选,筛选出20对多态性、重复性较好且条带清晰的引物,对30个菌株进行PCR扩增,共扩增出386条带,其中多态性条带有371条,多态性比率为96.11%,平均每对引物扩增出19.3个位点和18.55个多态性位点。UPGMA法聚类分析结果显示,供试菌株两两之间的遗传相似系数范围为0.69~0.90,平均为0.79,说明尖孢镰刀菌西瓜专化型的遗传多样性较为丰富。基于SRAP标记聚类分析表明,30个菌株在遗传相似系数为0.70处被划分为3个类群,I类群包含24个菌株,其中18个来自湖南省,Ⅱ类群只包含1个来自黑龙江省哈尔滨市的菌株,它和另一个来自黑龙江地区的菌株被划分到不同的类群,且遗传距离相对较远;Ⅲ类群包含了5个菌株,其中3个来自海南三亚,其余两个来自湖南省。根据菌株的分布情况来看,菌株的聚集与地理来源没有明显的相关性。

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