您好,欢迎访问湖南省农业科学院 机构知识库!

小飞蓬捕光叶绿素结合蛋白基因CcLhca-J9克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李祖任 1 ; 罗丁峰 1 ; 柏浩东 1 ; 徐晶晶 1 ; 韩进财 1 ; 徐强 2 ; 王若仲 2 ; 柏连阳 1 ;

作者机构: 1.湖南省农业科学院杂草生物学及安全防控生物学湖南省重点实验室

2.湖南农业大学植物激素与生长发育湖南省重点实验室

关键词: 小飞蓬;光捕获蛋白;基因克隆;分子对接;羊脂酸

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2021 年 54 卷 001 期

页码: 86-94

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [背景]恶性杂草小飞蓬(Conyzacanadensis)危害严重,有效治理手段匮乏.植物源羊脂酸可高效抑制小飞蓬光合作用,是一种具有开发潜力的灭生型植物源除草化合物.捕光叶绿素a/b结合蛋白(LHC)是光合系统I(PSI)中重要复合体蛋白,在植物进行光合作用中发挥关键作用.[目的]挖掘羊脂酸抑制小飞蓬的潜在靶标基因,为植物源羊脂酸除草剂的开发提供理论依据.[方法]采用同源克隆和RACE技术从小飞蓬叶片中克隆CcLhca-J9的全长序列,并利用DNAMAN分析其核酸序列特征.在NCBI中搜索LHC的高相似度氨基酸序列,采用邻接法构建系统进化树.利用SWISS-MODEL和ExPaSy在线预测分子量、等电点和蛋白结构.以同源建模结果作为模型,采用AutoDock 4.2软件分析羊脂酸与CcLhca-J9蛋白之间的亲和力.采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析羊脂酸和对照药剂阿魏酸及清水处理小飞蓬叶片后CcLhca-J9表达差异.[结果]成功获得小飞蓬CcLhca-J9,基因编码区全长为744 bp,编码247个氨基酸,分子量为26.766 kD,理论等电点为6.43,属于Chloroa_b-bind家族蛋白.系统进化分析表明,CcLhca-J9与除虫菊(GEW73959.1,Tanacetumcinerariifolium)和黄花蒿(PWA35049.1,Artemisiaannua)Lhca蛋白进化程度最为接近,同处于菊科这一分支,一致性超过85%,表明该基因家族保守性较强.CcLhca-J9蛋白二级结构具有螺旋、β转角、延伸链、无规则卷曲;以4y28.1.O(2.80?)为模板进行同源建模,三级结构是单分子物体,具有6个叶绿体a配体,是一个典型的捕光复合物I叶绿素a/b结合蛋白.分子对接显示,羊脂酸与CcLhca-J9蛋白的氨基酸残基Gly68、Phe67、Phe69和Arg197在结合过程中产生了氢键和p-π的作用力.RT-qPCR结果显示,羊脂酸胁迫处理小飞蓬叶片条件下,CcLhca-J9的表达量存在明显差异,药后0—8 h内随时间延长表达量表现出下降的趋势.与对照阿魏酸和清水处理相比,羊脂酸处理抑制了CcLhca-J9的表达.[结论]CcLhca-J9具有典型的捕光叶绿素a/b结合蛋白功能,可能参与了羊脂酸抑制小飞蓬叶片生长过程,是具有开发除草剂潜力的抑草靶标.

  • 相关文献

[1]小飞蓬捕光蛋白CcLhca-Z6基因克隆及羊脂酸胁迫下的表达分析. 徐晶晶,苑平,柏浩东,廖海民,李祖任. 2020

[2]植物源羊脂酸除草活性及其响应机制. 李祖任,柏连阳,黄勤勤,彭 琼,周 勇,周小毛. 2018

[3]植物源羊脂酸与草铵膦的最佳配比. 柏浩东,彭亚军,刘乐,徐晶晶,曹学平,李祖任. 2019

[4]植物源羊脂酸与3种商用除草剂多靶标协同除草. 柏浩东,罗丁峰,倪弦之,王立峰,唐剑泉,金晨钟,李祖任. 2021

[5]基于计算模拟与响应面分析漆酶对己烯雌酚的降解作用. 刘红艳,谢世伟,唐琳,张文强,张国琴,朱义年,单杨. 2020

[6]水稻矮秆基因定位和克隆的研究进展. 肖子发. 2010

[7]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016

[8]东乡野生稻苗期低温诱导表达新基因BGIOSGA013293-DX的过表达载体构建与转化. 李丁,夏玉梅,方真,唐宁,李祺,曹孟良. 2015

[9]水稻苗期耐冷性研究进展. 吴俊,柏斌,邓启云. 2015

[10]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016

[11]Rht12矮秆小麦GA3ox基因的克隆与表达分析. 阳文龙,郭小丽,翟晓,刘冬成. 2015

[12]普通野生稻耐冷性研究进展. 李小湘,潘孝武,刘文强. 2017

[13]黄瓜、西瓜和南瓜EIN3基因片段的克隆与序列分析. 卢向阳,许亮,许勇,张海英,刘晓虹. 2007

[14]不同性别黄瓜EIN3基因片段克隆及序列分析. 陈惠明,许亮,许勇,张海英,卢向阳. 2008

[15]稻米锌含量的遗传分析与基因克隆研究进展. 吴婷,李霞,黄凤林,胡标林. 2020

[16]植物SHMT基因家族研究进展. 倪弦之,柏浩东,韩进财,罗丁峰,李祖任,胡一鸿,金晨钟. 2021

[17]水稻窄叶突变体nrl2新等位基因的鉴定与功能分析. 姚栋萍,盛文涛,吴俊,柏斌,肖贵,傅爱斌. 2023

作者其他论文 更多>>