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不同地区穇子ITS序列比较及穇属物种聚类分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李基光 1 ; 汤睿 2 ; 欧立军 1 ; 王艳兰 2 ; 王利群 2 ; 陈光辉 1 ;

作者机构： 1.湖南农业大学农学院

2.湖南省作物研究所

关键词： 穇子(Eleusine coracana);ITS;分子鉴定;聚类分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2020 年 18 卷 024 期

页码： 8081-8091

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 穇子作为药食兼用的特色作物,对粮食安全和改善人们健康起着重要作用.为探究快速鉴定穇属物种的方法及确定穇子的亲缘关系,本研究对65个不同产地穇子居群的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行测序及比对,并构建穇属物种系统发育树.结果发现,穇子EC25、EC53和EC59等3个居群的ITS序列存在单碱基的突变体,其他居群无任何差异;穇属物种间ITS存在3~43个碱基的差异;系统聚类表明,穇属物种分为2大类4个亚组,其中穇子与凯芝济穇亲缘关系最近.研究表明,穇子的ITS序列具有高保守性而穇属种间差异性较大,ITS序列不能作为穇子居群的鉴定标记,可作为穇属物种鉴定的参考序列.本研究为穇子的亲缘关系鉴定及杂交育种提供了分子依据.

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