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基于基因组编辑技术的水稻靶向突变特征及遗传分析

文献类型: 中文期刊

作者: 李曜魁 1 ; 张丹 2 ; 毛毕刚 2 ; 吕启明 2 ; 胡远艺 2 ; 韶也 2 ; 彭彦 2 ; 赵炳然 2 ;

作者机构: 1.湖南农业大学生物科学技术学院

2.湖南杂交水稻研究中心

关键词: TALEN;CRISPR/Cas9;水稻;靶向突变;遗传特性

期刊名称: 遗传

ISSN: 0253-9772

年卷期: 2016 年 38 卷 08 期

页码: 746-755

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: TALEN(Transcription activator-like effector nucleases)系统和CRISPR/Cas9(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats/CRISPR-associated protein 9)系统是当前广泛应用的两大基因组编辑技术。本文比较分析了水稻(Oryza sativa L.)中这两大系统诱导突变的突变率、突变类型、突变位置、突变时间和遗传模式,发现TALEN系统和CRISPR/Cas9系统均可在T_0代水稻中有效诱发位点特异性突变,且CRISPR/Cas9的突变率更高。两大系统都以诱发10 bp以内的In Del突变为主,TALEN系统易诱导10 bp以内的缺失突变,而CRISPR/Cas9系统易诱导1 bp的插入突变,且CRISPR/Cas9系统诱发的DNA双链断裂(Double-strand breaks,DSBs)位置更加精确。此外,DSBs在修复过程中能以低频同源重组(Homologous recombination,HR)途径修复,产生DNA片段重复突变。对于相邻双靶点CRISPR/Cas9系统而言,双靶点间的DNA片段可发生缺失或倒位,这种双靶点间DNA片段突变的发生频率与双靶点各自的突变率无正相关性。两大系统诱导的突变最早发生在已转化的愈伤组织中,少量发生在水稻的体细胞中,导致了纯合突变、杂合突变、双等位突变和嵌合突变4种遗传模式,其中双等位突变比例最高,嵌合突变比例最低。除嵌合突变外,纯合突变、杂合突变、双等位突变的突变序列均可稳定遗传给下一代。

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