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拟南芥子叶与真叶差异基因的生物信息分析

文献类型: 中文期刊

作者: 侯昕 1 ;

作者机构: 1.武汉大学生命科学学院杂交水稻国家重点实验室

关键词: 拟南芥;叶;mRNA;生物信息

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2019 年 012 期

页码: 3894-3901

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为研究拟南芥子叶与真叶的发育过程,本研究以模式植物拟南芥为研究材料,通过二代测序、富集分析等生物信息学的方法探索子叶与真叶基因表达的不同.在拟南芥真叶相较于子叶的差异基因分析中,共得到了673个差异基因,其中上调的基因有570个,下调的基因有103个.进一步富集分析表明,拟南芥的真叶与子叶相比,真叶在光合作用以及细胞结构方面有大量差异基因富集,子叶则在糖原代谢以及一些次级代谢通路有大量差异基因富集.本研究结果为研究子叶特有的代谢通路提供了一定的理论基础.

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