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水稻磷脂酶PLD家族生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 康伟伟 1 ; 张超 1 ; 易自力 1 ; 陈智勇 1 ; 谭炎宁 2 ;

作者机构: 1.湖南农业大学生物科学技术学院

2.湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室

关键词: 水稻;磷脂酶PLD家族;生物信息学;基因表达

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2019 年 32 卷 010 期

页码: 2259-2264

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]磷脂酶PLD(Phospholipase D)家族是水稻中一类重要的蛋白,它在植物的生长发育调控以及非生物胁迫应答中发挥着重要作用.本研究旨在了解水稻PLD家族的基本信息.[方法]采用生物信息学的方法,对该家族16个成员基因的结构、蛋白基序、时空表达模式以及激素诱导表达模式等进行了分析.[结果]水稻PLD家族基因的长度为2982 ~11 305 bp,含有3~21个外显子,同亚类基因的外显子数目一致;所有家族成员在蛋白序列上表现出较高的相似性,除OsPLDφ,OsPLDκ外的大部分成员含有3种相同类型的基序.提取RiceXPro数据库中的表达数据后发现,PLD基因在根、茎、叶、花药、子房等部位中的表达量相对较高,而在胚芽和胚乳等部位中的表达量较低;PLD基因对不同激素的响应行为呈现出丰富的多样性,它们受茉莉酸(JA)和脱落酸(ABA)诱导表达,受油菜素内酯(BR)和细胞分裂素(CTK)所抑制,而对赤霉素(GA)和生长素(IAA)不敏感.[结论]成员含有相同类型的基序,表明它们在功能上具有保守性和一致性;各成员在不同激素处理后表现出不同的应答方式,暗示水稻PLD成员在逆境响应中执行不同的功能.这些研究结果为进一步研究水稻PLD家族基因的生物学功能奠定了基础.

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