文献类型: 中文期刊
作者: 康伟伟 1 ; 张超 1 ; 易自力 1 ; 陈智勇 1 ; 谭炎宁 2 ;
作者机构: 1.湖南农业大学生物科学技术学院
2.湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室
关键词: 水稻;磷脂酶PLD家族;生物信息学;基因表达
期刊名称: 西南农业学报
ISSN: 1001-4829
年卷期: 2019 年 32 卷 010 期
页码: 2259-2264
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: [目的]磷脂酶PLD(Phospholipase D)家族是水稻中一类重要的蛋白,它在植物的生长发育调控以及非生物胁迫应答中发挥着重要作用.本研究旨在了解水稻PLD家族的基本信息.[方法]采用生物信息学的方法,对该家族16个成员基因的结构、蛋白基序、时空表达模式以及激素诱导表达模式等进行了分析.[结果]水稻PLD家族基因的长度为2982 ~11 305 bp,含有3~21个外显子,同亚类基因的外显子数目一致;所有家族成员在蛋白序列上表现出较高的相似性,除OsPLDφ,OsPLDκ外的大部分成员含有3种相同类型的基序.提取RiceXPro数据库中的表达数据后发现,PLD基因在根、茎、叶、花药、子房等部位中的表达量相对较高,而在胚芽和胚乳等部位中的表达量较低;PLD基因对不同激素的响应行为呈现出丰富的多样性,它们受茉莉酸(JA)和脱落酸(ABA)诱导表达,受油菜素内酯(BR)和细胞分裂素(CTK)所抑制,而对赤霉素(GA)和生长素(IAA)不敏感.[结论]成员含有相同类型的基序,表明它们在功能上具有保守性和一致性;各成员在不同激素处理后表现出不同的应答方式,暗示水稻PLD成员在逆境响应中执行不同的功能.这些研究结果为进一步研究水稻PLD家族基因的生物学功能奠定了基础.
- 相关文献
[1]辣椒CaNRAMP基因家族的鉴定与表达分析. 刘峰,王运生. 2019
[2]水稻转录因子NF-YB家族的生物信息学分析. 余东,孙志忠,孙学武,谭炎宁,盛夏冰,段美娟,袁定阳. 2018
[3]水稻Os SSRP的生物信息学分析及耐盐性研究. 曾佳,刘玲,周天顺,荣秀琴,袁定阳,段美娟. 2022
[4]外源糖对水稻Ugp1基因表达调控研究. 张春晓,潘玉芳,陈荣智. 2011
[5]野生稻高产QTL导入晚稻恢复系的增产效果. 邓启云,陈立云,邓化冰,庄文,熊跃东. 2006
[6]水稻淡黄叶突变体安农标810S基因表达量的初步研究. 王国槐,青先国,郭清泉,宋克堡,李必湖,严明理. 2007
[7]水稻OsF-box基因表达的初步研究. 宋书锋,李懿星,符习勤. 2011
[8]CBF调节子在水稻品种日本晴和93-11低温驯化过程中的差异调控机制. 黎用朝,李小湘,刘文强,闵军,陆婷婷,盛新年,谭江. 2012
[9]水稻GATA基因家族生物信息学分析. 骆鹰,王有成,王伟平,张超. 2018
[10]水稻灌浆期谷蛋白亚基表达的初步分析. 黄琳,丁毅. 2011
[11]植物抗病基因研究进展. 王正华,曹孟良. 2006
[12]东乡野生稻RPS2类候选抗病基因的克隆与分析. 李磊,韩小霞,邢俊杰,李玲龙,阳志刚,罗秀娟,李丁,谢灵灵,曹孟良. 2009
[13]玉米FLA蛋白家族的生物信息学分析. 胡颖,陈亚波,宋群星. 2017
[14]甘蓝型油菜GPAT9基因克隆与生物信息学分析. 刘少锋,邬贤梦,官春云,熊兴华. 2016
[15]植物抗病基因研究进展. 王正华,曹孟良. 2006
[16]云南涮辣辣椒素合成酶基因的克隆与生物信息学分析. 文锦芬,霍金龙,朱海山,马春花,邹学校. 2012
[17]基因芯片技术在水稻抗逆基因表达研究中的应用. 刘鹏,陈由强,张建福,谢华安. 2012
[18]水杨酸对菊叶薯蓣中薯蓣皂素生物合成的影响. 李恒,王丽娟,杨昊,杨天龙,姜益泉,李家儒. 2015
[19]灰毡毛忍冬MADS-box基因家族AGL15基因的克隆、生物信息学和表达分析. 蔡嘉洛,朱贻霖,陈林,樊悦,刘峰,张亚丽,欧阳琳,刘湘丹. 2016
[20]辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析. 张亚利,胡灿,戴雄泽,刘峰,袁祖华. 2016
作者其他论文 更多>>
-
籼稻耐盐不育系的筛选及其生理分析
作者:谭颖;袁定阳;官志祥;曾建光;刘桃李;盛夏冰;王惠群;谭炎宁
关键词:籼稻;不育系;盐胁迫;耐盐性;可溶性糖
-
极端高温干旱条件下娄底市再生稻品种筛选试验初报
作者:陈海含;谭炎宁;赵湘群;唐咸瑞
关键词:再生稻;品种筛选;高产;高温干旱;娄底
-
强配合力抗稻瘟病两系恢复系P143的选育与应用
作者:彭锐;彭既明;李莉;朱益民;唐自标;艾治勇;孙志忠;谭炎宁;李懿星;赵梦熙;陈劲;张稳;刘梓琦;袁定阳
关键词:两系杂交水稻;恢复系;P143;抗稻瘟病;选育
-
水稻半矮杆突变体‘双辐矮糯’的农艺性状与遗传分析
作者:张林金;袁定阳;刘桃李;谭颖;杨震;曾建光;王学华;谭炎宁
关键词:水稻;双辐矮糯;株高;半矮杆;突变体
-
镉污染水稻种子内生细菌的分离及其耐镉性和植物促生性研究
作者:付少委;楚超群;黎妮;宋崇洋;梁爽;张超;王伟平;杨志伟
关键词:镉污染;水稻种子;内生细菌;重金属耐受性;植物生长促进性
-
DNA条形码在黄精属药用植物鉴定与遗传多样性分析中的应用
作者:龙炳宏;蒋向辉;宋荣;李胜华;肖龙骞;易自力;佘朝文
关键词:黄精属;DNA条形码;遗传多样性;ITS;matK;rbcL;psbA-trnH;psbK-psbl
-
水稻半矮杆突变体'双辐矮糯'的农艺性状与遗传分析
作者:张林金;袁定阳;刘桃李;谭颖;杨震;曾建光;王学华;谭炎宁
关键词:水稻;双辐矮糯;株高;半矮杆;突变体