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籼稻低亲和阳离子转运蛋白基因OsLCT2的克隆与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 唐丽 1 ; 毛毕刚 2 ; 赵炳然 3 ; 彭克勤 4 ;

作者机构： 1.湖南农业大学生物科学技术学院植物激素与生长収育湖南省重点实验室湖南杂交水稻研究中心杂交水稻国家重点实验室

2.中国农业科学院作物科学研究所

3.国家杂交水稻工程技术研究中心

4.湖南农业大学植物激素重点实验室

关键词： 水稻;镉;低亲和阳离子转运蛋白;OsLCT2

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2016 年 14 卷 05 期

页码： 1067-1074

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： OsLCT1是目前在水稻中唯一鉴定出来的参与韧皮部镉离子运输的关键转运蛋白,与水稻籽粒镉积累密切相关。本研究根据Gene Bank已发表的小麦Ta LCT1基因序列信息设计引物,利用RT-PCR方法从籼稻93-11和华占中克隆了低亲和阳离子转运蛋白基因(LCT),并命名为OsLCT2。生物信息学分析结果表明,该基因定位在5号染色体上,全长2 699 bp,包含3个外显子和2个内含子,其CDS全长1 437 bp,编码478个氨基酸,包含2个PEST序列和11个跨膜结构域。OsLCT2蛋白二级结构预测显示,α-螺旋占57.11%、β-折叠占7.74%,无规则卷曲占35.15%。序列比对和系统进化树分析结果表明,OsLCT2与小麦的亲缘关系最近达65%,其次为高粱64%,而与水稻OsLCT1的同源性并不高,推测OsLCT2的功能可能与Ta LCT1相类似。

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