文献类型: 中文期刊
作者: 张瑶婷 1 ; 王同华 2 ; 郭一鸣 2 ; 刘新红 2 ; 李宝 2 ; 李莓 1 ;
作者机构: 1.湖南大学研究生院隆平分院
2.湖南省作物研究所湖南省杂交油菜工程技术研究中心
关键词: 油菜;近缘种品系;单核苷酸多态性(SNP);遗传多样性;聚类分析
期刊名称: 分子植物育种
ISSN: 1672-416X
年卷期: 2023 年 006 期
页码: 1913-1919
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 为揭示湖南省油菜种质资源库中核心种质的遗传多样性,本研究利用油菜组60K基因芯片对266份甘蓝型油菜品系及其10份近缘种品系10份进行全基因组SNP位点分析,原始数据通过Visual Basic软件筛选,利用Powermarker软件计算SNP位点PIC值和供试材料的遗传距离、聚类分析。结果表明:根据SNP标记缺失率和染色体分布均匀度共筛选到24 593个SNP位点,平均每条染色体分布1 294个多态性位点,位点的Nei’s基因多样性指数(H)、主要等位基因频率(MAF)和多态性信息含量(PIC)平均值分别为0.401、0.688 3、0.316;276份供试材料间遗传距离在0.000 1~0.477之间,平均为0.329 6,Kinship值为0的占71.49%;供试材料可分成5个大类,其中最大类(含有250份种质)又可分为9个亚类,供试材料的类群分布与种质类型、地理来源一致。研究结果表明供试育种亲本种质遗传多样性丰富,可更客观反映供试材料的亲缘关系,为种质资源的育种利用提供理论依据。
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