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辣椒CaNRAMP基因家族的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘峰 1 ; 王运生 2 ;

作者机构： 1.湖南省农业科学院蔬菜研究所

2.湖南农业大学

关键词： 辣椒;NRAMP基因家族;生物信息学;基因表达

期刊名称： 江苏农业科学

ISSN： 1002-1302

年卷期： 2019 年 47 卷 010 期

页码： 69-74

收录情况： 北大核心

摘要： 为了初步研究辣椒(Capsicum annuum L.)NRAMP家族基因在重金属镉胁迫下的表达情况,通过生物信息学方法从辣椒基因组中鉴定出NRAMP基因,并对这些基因的序列结构、系统进化树、表达谱等进行系统分析.结果表明,辣椒中含有5个具有典型NRAMP结构域的基因,根据其在染色体上的位置,分别将其命名为CaNRAMP1~CaNRAMP5,根据系统进化分析,将辣椒的NRAMP基因分为2类,Ⅰ类包含2个基因(CaNRAMP1、CaNRAMP3),分别含有10、12个内含子,Ⅱ类包含3个基因(CaNRAMP2、CaNRAMP4、CaNRAMP5),均含有3个内含子.基于基因组织表达模式的分析结果表明,CaNRAMP1在不同组织中均未检测到其表达;CaNRAMP5的表达集中在花器官,其余CaNRAMP基因均有不同的表达模式;通过逆转录定量PCR(qRT-PCR)分析发现,辣椒苗期中的叶片经过镉处理后,CaNRAMP3基因呈明显上调的趋势,参与镉胁迫反应的正向调控,其他基因则不参与镉胁迫反应的调控.研究结果为进一步分析辣椒NRAMP基因家族的功能奠定了基础.

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