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辣椒全基因组中LBD转录因子的鉴定与表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张亚利 1 ; 胡灿 2 ; 戴雄泽 2 ; 刘峰 2 ; 袁祖华 3 ;

作者机构： 1.湖南中医药大学药学院

2.湖南省农业科学院蔬菜研究所

3.中南大学研究生院隆平分院

关键词： 辣椒;LBD基因家族;进化分析;基因表达

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2016 年 43 卷 04 期

页码： 683-694

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用生物信息学的方法,从辣椒基因组中鉴定出45个LBD基因,这些基因分布于辣椒9条染色体上。该家族成员内含子数整体上不超过3个,结构相对简单。进化关系显示辣椒LBD基因可分为ClassⅠ和ClassⅡ两大类,细分为Ⅰa、Ⅰb、Ⅰc、Ⅰd、Ⅰe、Ⅱa和Ⅱb等7个亚类。不同组织和发育时期的表达模式研究发现,该基因家族具有一定的时空表达特异性。qRT-PCR结果表明,热激胁迫可以明显激活或抑制部分LBD基因的表达,其中ClassⅡ类基因较ClassⅠ类对高温具有更高的敏感性。

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