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不同水稻品种种子固有细菌群落的多样性

文献类型: 中文期刊

作者: 刘琳 1 ; 刘洋 1 ; 赵亮 1 ; 邓启云 2 ; 吴俊 2 ; 庄文 2 ; 宋未 1 ;

作者机构: 1.首都师范大学生命科学学院

2.国家杂交水稻工程技术研究中心

关键词: 群落多样性;杂交水稻;固有细菌;亲本;子代;种子微生物生态学

期刊名称: 植物生态学报

ISSN: 1005-264X

年卷期: 2012 年 36 卷 08 期

页码: 880-890

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 种子固有细菌是植物内生细菌的重要来源,对植物的健康以及接种细菌的定殖能产生重要影响。该文以杂交水稻(Oryza sativa)种子为研究对象,比较研究了不同品种水稻种子中固有细菌群落的多样性。利用799f和1492r这对引物成功地从水稻种子中扩增出固有细菌16SrDNA片段;通过构建16SrDNA文库和扩增核糖体RNA基因酶切分型(ARDRA)的方法,对杂交水稻‘丰优611’(‘丰源A’ב远恢611’)、‘金优611’(‘金23A’ב远恢611’)和‘金23A/09H013’(‘金23A’ב09H013’)3个组合的子代及其各自亲本的种子固有细菌群落结构的多样性进行了研究。构建的7个克隆文库中,每个文库含有200–300个克隆,30–40个操作分类单元(OTU),对ARDRA分型得到的代表序列进行分析,在16SrDNA文库中发现多种细菌类群,包括α变形杆菌(α-Proteobacteria)、β变形杆菌、γ变形杆菌、放线菌(Actinobacteria)、厚壁菌(Firmicutes)和拟菌(Bacteroidetes),优势菌属是泛菌属(Pantoea)和芽孢杆菌属(Bacillus)。不同品种的水稻种子固有细菌群落结构不同,而杂交子代种子中的优势菌与亲本种子中的优势菌在种类和数量上都具有一定的相关性。此外,子代种子中丰度5%以上的细菌也能在各自父本或母本中检测到。

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