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辣椒CAMTA基因家族生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 蒋宏华 1 ; 李丽 2 ; 李雪峰 1 ;

作者机构： 1.湖南省蔬菜研究所

2.湖南省农业科学院科研基地管理中心

关键词： 辣椒;CAMTA基因家族;生物信息学分析;胁迫;表达分析

期刊名称： 中国蔬菜

ISSN： 1000-6346

年卷期： 2022 年 009 期

页码： 47-56

收录情况： 北大核心

摘要： 为了解辣椒中CAMTA基因家族生物信息学功能,探究其在非生物胁迫下的基因表达规律,进而为辣椒CAMTA基因的功能开发与抗逆育种提供基础,在PlantTFDB网站得到辣椒CAMTA家族成员,并对其基因结构、结构域、蛋白质三级结构、系统进化关系、顺式作用元件、激素处理与非生物胁迫表达情况进行分析.结果表明,在辣椒中有5个CAMTA家族成员,均包含CG-1保守结构域;主要分布在4条染色体上,其基因大小差异明显,氨基酸数目在89~1023个之间,外显子数目为1~13个.进化树分析表明,辣椒CAMTA基因家族可以分为3类,辣椒CAMTA的氨基酸序列与番茄CAMTA的氨基酸序列亲缘关系最近.基因表达量分析表明,辣椒CAMTA基因家族在胁迫后的信号转导和组织发育过程中发挥了作用.

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