文献类型: 中文期刊
作者: 鲁清华 1 ; 张宇 1 ; 张松柏 1 ; 彭静 1 ; 郑立敏 1 ; 张德咏 1 ; 刘勇 1 ;
作者机构: 1.湖南大学隆平分院;湖南省农业科学院植物保护研究所
关键词: 番茄黄化曲叶病毒;番茄;检测;湖南长沙
期刊名称: 南方农业学报
ISSN: 2095-1191
年卷期: 2018 年 49 卷 07 期
页码: 1332-1337
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 【目的】对湖南省长沙市发生的疑似番茄黄化曲叶病毒(TYLCV)样本进行检测,明确TYLCV在湖南长沙的发生情况,为TYLCV的防控提供科学依据。【方法】2016年3和11月,在湖南长沙采集疑似TYLCV样本48份,采用已发表的TYLCV不同株系的全基因组序列,利用DNAMAN进行序列比对,根据保守序列设计特异性引物TY-T-F和TYT-R、TY-P-F和TY-P-R对番茄样本的DNA进行PCR、Southern印迹杂交(Sourthern blotting)检测和系统发育分析。对呈阳性条带的PCR产物进行切胶回收并送样测序,在NCBI上进行BLAST比对分析,利用系统发育分析TYLCV湖南长沙分离物与国内外株系的相似性。【结果】采集的48份样本中有42份样本能扩增出目的条带,阳性检出率为87.5%;将42个阳性克隆序列导入MEGA 7.0,得到27个分离物。对测序结果进行同源性分析、多重比对、聚类分析及进化分析,结果显示27个湖南长沙TYLCV分离物与我国其他省(市)分离物的相似性在98.5%~99.8%,与伊朗株系(AJ132711和GU076453)、墨西哥株系(FJ012358)、澳大利亚株系(GU178814)和葡萄牙株系(AF105975)的相似性分别介于90.7%~91.5%、95.4%~95.5%、98.6%~98.8%和99.3%~99.4%。【结论】TYLCV已在湖南长沙发生危害,需加强检疫工作,防止从疫区调运感病番茄,以控制病害扩散蔓延。
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