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资源类型: 中文期刊
关键词:分子进化(模糊匹配)
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瓜类褪绿黄化病毒自然侵染南瓜及分子进化分析

植物病理学报 2021 北大核心 CSCD

摘要:瓜类褪绿黄化病毒(cucurbit chlorotic yellows virus,CCYV)可侵染多种瓜类,主要危害叶片,影响其光合作用,导致减产。采集湖南省南瓜疑似病毒病样品经siRNA测序发现CCYV,进一步RT-PCR验证CCYV可自然侵染南瓜,检出率为5.78%,这是我国内地首次发现CCYV可自然侵染南瓜。持续调查发现CCYV侵染湖南南瓜呈逐年上升趋势。克隆CCYV CP基因,进行系统发生、遗传变异、选择压力和基因漂流分析,发现CCYV种群分布呈明显地理相关性。自然选择和遗传漂变是CCYV进化的主要驱动力,中国种群存在正选择作用,CCYV正在发生适应性改变。CCYV种群数量正处于扩张状态。研究结果可为CCYV侵染南瓜的预警和防控提供科技支撑。

关键词: 南瓜 瓜类褪绿黄化病毒 外壳蛋白 分子进化 自然侵染

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长沙地区南瓜的小西葫芦黄花叶病毒检测及其分子进化分析

湖南农业大学学报(自然科学版) 2017 北大核心 CSCD

摘要:对长沙地区160份南瓜疑似病毒病样品进行小西葫芦黄花叶病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)检测,检出率达46.9%。为进一步明确长沙地区ZYMV分离物的分类地位和分子进化特征,克隆获得了1个长沙地区ZYMV外壳蛋白基因,与Gen Bank已报道的ZYMV外壳蛋白基因比对,并进行基因重组、系统发生、遗传差异、选择压力、种群结构和基因漂流分析。结果显示:长沙地区ZYMV外壳蛋白基因没有发生明显的重组,突变与负选择作用是其进化的主要驱动力,种群结构相对稳定,但正处于扩张的趋势中;ZYMV不同分离物外壳蛋白基因形成3个有明显地理相关性的美洲、欧洲和亚洲种群,美洲和欧洲种群与亚洲种群之间基因交流不频繁,可能受到遗传漂变的影响,而欧洲种群与亚洲种群之间基因交流较频繁。

关键词: 南瓜 小西葫芦黄花叶病毒 外壳蛋白 分子进化 长沙地区

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