科研产出
生菜HSF基因家族的全基因组鉴定与表达分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：利用生菜的全基因组数据,采用生物信息学方法,从生菜中鉴定出了 35个LsHSF基因,按照其在染色体上的分布顺序命名为LsHSF1,LsHSF2,…,LsHSF35,并对其理化性质、染色体定位、与拟南芥的进化关系、蛋白保守基序、组织表达水平及褪黑素处理后高温条件下的表达量进行分析.亚细胞定位预测分析结果显示,除LsHSF11、LsHSF17定位在叶绿体,LsHSF34定位在液泡外,其余基因都定位在细胞核中;35 个LsHSF基因不均等地分布在 9条染色体上;蛋白保守基序预测分析结果显示,所有LsHSF基因都含有Motif 1 与Motif 2,且存在紧密联系;系统发育树分析结果表明,HSF蛋白分为A、B和C共 3组,被划分为 14个主要亚家族;组织表达水平分析结果表明,HSF等基因具有特异性表达模式;高温处理能够刺激HSF基因家族成员的表达.
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全基因组基因嵌入突变体库用于发掘野生稻有用基因及超级杂交稻分子育种的策略
《分子植物育种 》 2005 CSCD
摘要：纵观水稻育种的历程,每一次新突破都离不开新技术的利用和新遗传种质资源的发掘。超级杂交稻在达到第二期12000kg/hm2的目标后,进一步挖掘产量潜力实现13500kg/hm2的第三期目标需要基因资源创新和分子育种技术的加盟。利用可转化大片断基因组文库和基因嵌入突变体库是发掘野生稻有利基因的新策略,它包括构建野生稻可转化大片断基因组文库,通过转基因技术,将大片段克隆导入栽培稻中,建立全基因组基因嵌入突变体库。在构建突变体库前可根据保守序列、分子标记等对大片段克隆进行筛选,减少需要鉴定的大片段克隆数量,并可利用遗传转化效率高的模式植物拟南芥来进行大片段克隆初步鉴定,避开水稻转化效率仍然不高这个瓶颈。然后通过突变体田间鉴定,筛选出抗寒、抗虫、抗病、高产等突变体材料并应用到超级杂交稻育种中;同时对控制突变性状的大片段克隆进行亚克隆、功能补偿分析和序列分析,最终克隆野生稻有利基因。这一技术也适用于发掘和克隆其他植物基因。
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