科研产出
辣椒抗炭疽病材料筛选及转录组分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2025 北大核心 CSCD
摘要：从田间自然发病辣椒果实中分离培养得到辣椒炭疽病病原菌X，并应用该炭疽病病原菌对112份辣椒材料的离体果实和幼苗进行抗炭疽病抗性鉴定，筛选抗病品种，并对抗性品种进行转录组分析。结果表明：病原菌X经形态学及分子生物学鉴定，鉴定为果生刺盘孢炭疽菌(Colletotrichum fructicola)；对112份辣椒离体果实材料进行筛选，共获得3个抗性材料RX12–160、X–738–1、RX22–1016,109个感病材料；对3个抗病品种进行辣椒苗期活体抗性鉴定，最后鉴定RX22–1016为良好的抗病品种，并对其接种果生刺盘孢炭疽菌后的转录组进行了GO富集分析和KEGG通路富集分析；GO富集程度较高的过程为光系统I中的光合电子传递、NAD(P)H脱氢酶复合物的组装、光合作用及光系统I中的光收集等；KEGG富集程度较高的通路为苯丙素的生物合成、谷胱甘肽代谢、淀粉和蔗糖代谢、光合生物的固碳作用和糖酵解/糖异生等通路；共有的表达差异基因主要集中在苯丙素生物合成和谷胱甘肽代谢等通路上；在RX22–1016与炭疽菌互作中，Caz03g16640、Caz01g15210、Caz04g07320和Caz04g01720基因在互作初期均呈现上调趋势，推测这4个基因可能参与调控与抗病相关的物质的合成。
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第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析
《遗传 》 2012 北大核心 CSCD
摘要：稻瘟菌为了实现对水稻的有效侵染,在侵染水稻时可能通过表达和转运一定数量的效应蛋白进入到水稻细胞,抑制和干扰水稻的先天免疫机制。文章利用Solexa第二代测序技术,通过开展水稻和稻瘟菌互作早期转录组的测定和分析,克隆和鉴定在互作早期表达的稻瘟菌效应蛋白基因。利用序列同源比对,我们从总计约12.5 M条序列标签中,分离和鉴定了338 942条来源于稻瘟菌的序列,并最终定位到779个稻瘟菌预测基因。其中108个基因很可能参与了水稻和稻瘟菌互作过程,42个基因为预测的分泌蛋白基因。通过RT-PCR分析,最终确认了42个预测分泌蛋白基因中有12个基因在侵染水稻早期有显著的表达,而其中有4个基因表现为侵染早期特异表达。文章尝试利用第二代测序技术实现稻瘟菌侵染早期特异表达基因,尤其是分泌蛋白基因的快速克隆和鉴定,为稻瘟菌效应蛋白基因的克隆和功能鉴定提供了较为有意义的探索。
关键词： Solexa测序技术 分泌蛋白 转录组分析 表达特异性 稻瘟菌
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