科研产出
基于病毒诱导的基因沉默(VIGS)方法的LsRGL1基因在生菜中的功能分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：为了确定LsRGL1基因对生菜抽薹的影响，以S39生菜品种为试验材料，通过逆转录聚合酶链反应(RT–PCR)从S39生菜品种中克隆得到LsRGL1基因；采用病毒诱导基因沉默(VIGS)方法，利用烟草脆裂病毒(TRV)载体对目的基因进行沉默；采用表型观察、石蜡切片、实时荧光定量PCR(qPCR)方法、酶联免疫吸附法(ELISA)分别研究空白对照组(无TRV载体)、阴性对照组(按质量比1∶1同时注射TRV1空载体和TRV2空载体)和试验组(按质量比1∶1同时注射TRV1空载体和TRV2–LsRGL1重组载体)中植株表型、花芽分化、LsRGL1基因的相对表达量和内源激素质量分数的变化。结果表明：病毒侵染后，试验组植株的茎长相对于空白对照组和阴性对照组的茎长明显增大，且试验组各项表型数据均大于2个对照组的表型数据，而空白对照组与阴性对照组各项表型数据之间并未出现明显差异；石蜡切片结果表明试验组植株已经开始花芽分化，相较于对照组提前进入生殖生长时期；q PCR分析结果显示，试验组中LsRGL1基因的相对表达量相较于空白组和阴性对照组的显著下调，且下调幅度均超过50%。试验组中内源激素赤霉素(GA3)、脱落酸(ABA)、生长素(IAA)的含量显著高于对照组的含量，而茉莉酸(JA)含量显著下降。综上可知，沉默LsRGL1基因加快了生菜的抽薹。
关键词： 生菜 表达分析 内源激素 病毒诱导的基因沉默(VIGS)
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生菜HSF基因家族的全基因组鉴定与表达分析
《湖南农业大学学报(自然科学版) 》 2024 北大核心 CSCD
摘要：利用生菜的全基因组数据,采用生物信息学方法,从生菜中鉴定出了 35个LsHSF基因,按照其在染色体上的分布顺序命名为LsHSF1,LsHSF2,…,LsHSF35,并对其理化性质、染色体定位、与拟南芥的进化关系、蛋白保守基序、组织表达水平及褪黑素处理后高温条件下的表达量进行分析.亚细胞定位预测分析结果显示,除LsHSF11、LsHSF17定位在叶绿体,LsHSF34定位在液泡外,其余基因都定位在细胞核中;35 个LsHSF基因不均等地分布在 9条染色体上;蛋白保守基序预测分析结果显示,所有LsHSF基因都含有Motif 1 与Motif 2,且存在紧密联系;系统发育树分析结果表明,HSF蛋白分为A、B和C共 3组,被划分为 14个主要亚家族;组织表达水平分析结果表明,HSF等基因具有特异性表达模式;高温处理能够刺激HSF基因家族成员的表达.
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