马铃薯实质派生品种鉴定的基因组学技术

简燕; 李小波; 王博; 赵静; 索海翠; 黄安平; 胡柏耿; 曹春梅; 张勇飞; 《中国马铃薯 》 2020

摘要：马铃薯实质派生品种的准确鉴定技术已成为世界性的热点之一,但是世界马铃薯界尚没有发表简单可行和置信度高的实质派生品种检测方法.针对这一问题开展研究有着重大的现实意义.研究结合进化遗传中系统进化树的枝长计算方法与动物遗传学领域中的特征分值计算方法,利用20个马铃薯品种薯块作为研究材料,其中马铃薯品种'合作88'的3个不同地域来源的样品作为内控样品,从概念的提出到验证两个角度,分别对马铃薯品种的实质派生品种鉴定技术进行了基于重测序的基因组学分析.结果表明,特征分值及进化树枝长两种方法,均可准确检测马铃薯品种间的实质等同现象,发现两个不同品种'黑金刚'和'华颂66'具有比内控样品更小的系统进化枝长,因此可判断二者是实质派生品种.研究为管理部门评估马铃薯品种遗传相似度,解决实质派生品种鉴定问题提供了有效方法.

关键词： 实质派生品种 相似度检测 特征分值 系统进化树枝长